Protein–RNA interactions for Protein: O88544

Cops4, COP9 signalosome complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops4O88544 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops4O88544 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops4O88544 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops4O88544 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops4O88544 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops4O88544 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops4O88544 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops4O88544 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops4O88544 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops4O88544 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops4O88544 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops4O88544 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops4O88544 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops4O88544 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops4O88544 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops4O88544 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops4O88544 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops4O88544 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops4O88544 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops4O88544 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops4O88544 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops4O88544 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops4O88544 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops4O88544 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops4O88544 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops4O88544 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops4O88544 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops4O88544 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops4O88544 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops4O88544 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops4O88544 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops4O88544 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops4O88544 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops4O88544 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops4O88544 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops4O88544 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops4O88544 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops4O88544 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops4O88544 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops4O88544 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops4O88544 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops4O88544 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops4O88544 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops4O88544 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops4O88544 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops4O88544 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops4O88544 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cops4O88544 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cops4O88544 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cops4O88544 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cops4O88544 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cops4O88544 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms