Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vamp4O70480 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vamp4O70480 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vamp4O70480 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vamp4O70480 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vamp4O70480 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vamp4O70480 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vamp4O70480 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vamp4O70480 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Vamp4O70480 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Vamp4O70480 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vamp4O70480 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vamp4O70480 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vamp4O70480 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vamp4O70480 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vamp4O70480 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vamp4O70480 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vamp4O70480 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Vamp4O70480 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vamp4O70480 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vamp4O70480 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vamp4O70480 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vamp4O70480 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vamp4O70480 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vamp4O70480 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vamp4O70480 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vamp4O70480 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vamp4O70480 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vamp4O70480 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vamp4O70480 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vamp4O70480 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vamp4O70480 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vamp4O70480 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vamp4O70480 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vamp4O70480 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vamp4O70480 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vamp4O70480 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vamp4O70480 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vamp4O70480 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vamp4O70480 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vamp4O70480 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vamp4O70480 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vamp4O70480 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Vamp4O70480 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vamp4O70480 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vamp4O70480 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Vamp4O70480 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vamp4O70480 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vamp4O70480 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vamp4O70480 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vamp4O70480 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vamp4O70480 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vamp4O70480 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vamp4O70480 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vamp4O70480 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vamp4O70480 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vamp4O70480 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Vamp4O70480 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vamp4O70480 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vamp4O70480 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vamp4O70480 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vamp4O70480 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vamp4O70480 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vamp4O70480 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vamp4O70480 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vamp4O70480 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vamp4O70480 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vamp4O70480 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vamp4O70480 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vamp4O70480 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vamp4O70480 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vamp4O70480 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vamp4O70480 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vamp4O70480 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Vamp4O70480 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vamp4O70480 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vamp4O70480 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vamp4O70480 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vamp4O70480 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vamp4O70480 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vamp4O70480 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vamp4O70480 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vamp4O70480 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vamp4O70480 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vamp4O70480 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vamp4O70480 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vamp4O70480 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vamp4O70480 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vamp4O70480 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vamp4O70480 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vamp4O70480 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vamp4O70480 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vamp4O70480 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vamp4O70480 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vamp4O70480 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Vamp4O70480 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vamp4O70480 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vamp4O70480 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vamp4O70480 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vamp4O70480 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms