Protein–RNA interactions for Protein: O70220

Foxq1, Forkhead box protein Q1, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxq1O70220 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxq1O70220 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxq1O70220 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxq1O70220 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxq1O70220 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxq1O70220 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxq1O70220 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxq1O70220 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxq1O70220 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxq1O70220 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxq1O70220 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxq1O70220 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxq1O70220 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxq1O70220 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxq1O70220 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxq1O70220 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxq1O70220 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxq1O70220 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxq1O70220 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxq1O70220 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxq1O70220 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxq1O70220 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxq1O70220 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxq1O70220 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxq1O70220 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxq1O70220 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxq1O70220 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxq1O70220 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Foxq1O70220 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Foxq1O70220 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Foxq1O70220 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Foxq1O70220 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Foxq1O70220 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Foxq1O70220 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxq1O70220 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxq1O70220 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxq1O70220 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxq1O70220 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxq1O70220 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxq1O70220 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxq1O70220 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxq1O70220 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxq1O70220 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxq1O70220 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxq1O70220 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxq1O70220 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxq1O70220 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxq1O70220 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxq1O70220 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxq1O70220 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxq1O70220 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxq1O70220 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxq1O70220 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxq1O70220 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxq1O70220 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxq1O70220 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxq1O70220 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxq1O70220 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxq1O70220 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxq1O70220 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxq1O70220 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxq1O70220 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxq1O70220 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Foxq1O70220 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Foxq1O70220 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxq1O70220 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxq1O70220 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxq1O70220 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Foxq1O70220 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxq1O70220 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxq1O70220 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxq1O70220 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxq1O70220 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxq1O70220 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxq1O70220 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Foxq1O70220 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Foxq1O70220 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Foxq1O70220 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Foxq1O70220 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxq1O70220 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Foxq1O70220 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Foxq1O70220 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxq1O70220 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxq1O70220 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxq1O70220 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxq1O70220 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxq1O70220 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxq1O70220 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxq1O70220 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxq1O70220 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxq1O70220 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxq1O70220 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxq1O70220 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxq1O70220 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxq1O70220 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxq1O70220 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxq1O70220 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxq1O70220 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxq1O70220 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxq1O70220 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms