Protein–RNA interactions for Protein: O55237

Cd70, CD70 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd70O55237 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cd70O55237 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cd70O55237 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cd70O55237 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cd70O55237 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cd70O55237 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cd70O55237 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cd70O55237 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cd70O55237 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cd70O55237 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cd70O55237 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cd70O55237 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cd70O55237 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cd70O55237 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cd70O55237 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Cd70O55237 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cd70O55237 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cd70O55237 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cd70O55237 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cd70O55237 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cd70O55237 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cd70O55237 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cd70O55237 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cd70O55237 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cd70O55237 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cd70O55237 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Cd70O55237 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cd70O55237 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cd70O55237 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Cd70O55237 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Cd70O55237 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cd70O55237 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cd70O55237 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cd70O55237 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cd70O55237 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cd70O55237 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cd70O55237 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cd70O55237 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cd70O55237 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cd70O55237 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cd70O55237 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cd70O55237 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cd70O55237 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cd70O55237 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cd70O55237 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cd70O55237 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cd70O55237 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cd70O55237 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cd70O55237 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Cd70O55237 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cd70O55237 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cd70O55237 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cd70O55237 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cd70O55237 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd70O55237 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd70O55237 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd70O55237 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd70O55237 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd70O55237 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd70O55237 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd70O55237 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd70O55237 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd70O55237 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd70O55237 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd70O55237 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd70O55237 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd70O55237 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd70O55237 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd70O55237 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd70O55237 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd70O55237 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd70O55237 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd70O55237 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd70O55237 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd70O55237 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd70O55237 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd70O55237 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd70O55237 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd70O55237 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd70O55237 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd70O55237 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd70O55237 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd70O55237 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd70O55237 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd70O55237 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd70O55237 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd70O55237 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd70O55237 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd70O55237 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd70O55237 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd70O55237 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd70O55237 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd70O55237 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd70O55237 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd70O55237 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd70O55237 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd70O55237 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd70O55237 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd70O55237 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd70O55237 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms