Protein–RNA interactions for Protein: O55230

Rad51d, DNA repair protein RAD51 homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad51dO55230 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rad51dO55230 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rad51dO55230 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rad51dO55230 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rad51dO55230 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rad51dO55230 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rad51dO55230 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad51dO55230 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad51dO55230 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad51dO55230 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad51dO55230 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad51dO55230 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad51dO55230 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad51dO55230 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad51dO55230 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad51dO55230 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad51dO55230 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad51dO55230 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad51dO55230 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad51dO55230 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad51dO55230 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad51dO55230 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad51dO55230 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad51dO55230 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad51dO55230 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad51dO55230 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad51dO55230 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad51dO55230 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad51dO55230 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad51dO55230 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad51dO55230 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad51dO55230 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad51dO55230 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad51dO55230 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad51dO55230 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rad51dO55230 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rad51dO55230 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rad51dO55230 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rad51dO55230 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rad51dO55230 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rad51dO55230 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rad51dO55230 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rad51dO55230 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rad51dO55230 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rad51dO55230 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rad51dO55230 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rad51dO55230 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rad51dO55230 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rad51dO55230 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rad51dO55230 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rad51dO55230 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rad51dO55230 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rad51dO55230 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rad51dO55230 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rad51dO55230 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rad51dO55230 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rad51dO55230 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rad51dO55230 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rad51dO55230 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rad51dO55230 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rad51dO55230 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rad51dO55230 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rad51dO55230 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rad51dO55230 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rad51dO55230 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rad51dO55230 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rad51dO55230 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rad51dO55230 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rad51dO55230 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rad51dO55230 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rad51dO55230 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rad51dO55230 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rad51dO55230 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rad51dO55230 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rad51dO55230 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rad51dO55230 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rad51dO55230 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rad51dO55230 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rad51dO55230 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rad51dO55230 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rad51dO55230 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rad51dO55230 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rad51dO55230 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rad51dO55230 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rad51dO55230 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rad51dO55230 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rad51dO55230 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rad51dO55230 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rad51dO55230 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rad51dO55230 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rad51dO55230 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rad51dO55230 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rad51dO55230 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rad51dO55230 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rad51dO55230 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rad51dO55230 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Rad51dO55230 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rad51dO55230 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rad51dO55230 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rad51dO55230 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms