Protein–RNA interactions for Protein: O55208

Figla, Factor in the germline alpha, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FiglaO55208 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FiglaO55208 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FiglaO55208 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FiglaO55208 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FiglaO55208 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FiglaO55208 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FiglaO55208 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FiglaO55208 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FiglaO55208 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FiglaO55208 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FiglaO55208 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FiglaO55208 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FiglaO55208 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FiglaO55208 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FiglaO55208 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FiglaO55208 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FiglaO55208 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FiglaO55208 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FiglaO55208 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FiglaO55208 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FiglaO55208 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FiglaO55208 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FiglaO55208 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FiglaO55208 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FiglaO55208 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FiglaO55208 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FiglaO55208 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FiglaO55208 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FiglaO55208 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FiglaO55208 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FiglaO55208 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FiglaO55208 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FiglaO55208 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FiglaO55208 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FiglaO55208 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FiglaO55208 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FiglaO55208 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FiglaO55208 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms