Protein–RNA interactions for Protein: O55100

Syngr1, Synaptogyrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr1O55100 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syngr1O55100 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms