Protein–RNA interactions for Protein: O54951

Sema6b, Semaphorin-6B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6bO54951 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sema6bO54951 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sema6bO54951 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sema6bO54951 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sema6bO54951 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sema6bO54951 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sema6bO54951 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sema6bO54951 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sema6bO54951 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sema6bO54951 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Sema6bO54951 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sema6bO54951 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sema6bO54951 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sema6bO54951 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sema6bO54951 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sema6bO54951 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sema6bO54951 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sema6bO54951 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sema6bO54951 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Sema6bO54951 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sema6bO54951 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sema6bO54951 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sema6bO54951 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sema6bO54951 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sema6bO54951 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sema6bO54951 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sema6bO54951 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sema6bO54951 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Sema6bO54951 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sema6bO54951 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sema6bO54951 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sema6bO54951 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sema6bO54951 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Sema6bO54951 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sema6bO54951 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sema6bO54951 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sema6bO54951 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sema6bO54951 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sema6bO54951 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sema6bO54951 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sema6bO54951 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sema6bO54951 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Sema6bO54951 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Sema6bO54951 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sema6bO54951 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Sema6bO54951 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sema6bO54951 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sema6bO54951 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sema6bO54951 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sema6bO54951 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sema6bO54951 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sema6bO54951 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sema6bO54951 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sema6bO54951 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sema6bO54951 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sema6bO54951 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sema6bO54951 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sema6bO54951 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sema6bO54951 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sema6bO54951 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Sema6bO54951 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sema6bO54951 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sema6bO54951 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sema6bO54951 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sema6bO54951 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Sema6bO54951 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sema6bO54951 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sema6bO54951 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sema6bO54951 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sema6bO54951 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sema6bO54951 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sema6bO54951 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sema6bO54951 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sema6bO54951 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sema6bO54951 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Sema6bO54951 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Sema6bO54951 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Sema6bO54951 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Sema6bO54951 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sema6bO54951 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sema6bO54951 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sema6bO54951 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sema6bO54951 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Sema6bO54951 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sema6bO54951 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sema6bO54951 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sema6bO54951 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sema6bO54951 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Sema6bO54951 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sema6bO54951 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Sema6bO54951 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sema6bO54951 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sema6bO54951 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sema6bO54951 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sema6bO54951 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sema6bO54951 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sema6bO54951 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sema6bO54951 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sema6bO54951 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sema6bO54951 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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