Protein–RNA interactions for Protein: O54827

Atp10a, Probable phospholipid-transporting ATPase VA, mousemouse

Predictions only

Length 1,508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp10aO54827 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp10aO54827 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp10aO54827 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp10aO54827 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp10aO54827 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp10aO54827 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp10aO54827 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp10aO54827 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp10aO54827 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp10aO54827 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp10aO54827 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp10aO54827 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp10aO54827 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp10aO54827 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp10aO54827 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp10aO54827 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp10aO54827 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp10aO54827 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp10aO54827 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp10aO54827 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp10aO54827 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp10aO54827 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp10aO54827 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
Atp10aO54827 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp10aO54827 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp10aO54827 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp10aO54827 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp10aO54827 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp10aO54827 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp10aO54827 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp10aO54827 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp10aO54827 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp10aO54827 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp10aO54827 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp10aO54827 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp10aO54827 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp10aO54827 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp10aO54827 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp10aO54827 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp10aO54827 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp10aO54827 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp10aO54827 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp10aO54827 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp10aO54827 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp10aO54827 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp10aO54827 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp10aO54827 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp10aO54827 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp10aO54827 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp10aO54827 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp10aO54827 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp10aO54827 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp10aO54827 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp10aO54827 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp10aO54827 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp10aO54827 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp10aO54827 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp10aO54827 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp10aO54827 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp10aO54827 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp10aO54827 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp10aO54827 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp10aO54827 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp10aO54827 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp10aO54827 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp10aO54827 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp10aO54827 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp10aO54827 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp10aO54827 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp10aO54827 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp10aO54827 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp10aO54827 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp10aO54827 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp10aO54827 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp10aO54827 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp10aO54827 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp10aO54827 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp10aO54827 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp10aO54827 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp10aO54827 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp10aO54827 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp10aO54827 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp10aO54827 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp10aO54827 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp10aO54827 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp10aO54827 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp10aO54827 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp10aO54827 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp10aO54827 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp10aO54827 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp10aO54827 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp10aO54827 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp10aO54827 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp10aO54827 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp10aO54827 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp10aO54827 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp10aO54827 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp10aO54827 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp10aO54827 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Atp10aO54827 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms