Protein–RNA interactions for Protein: O54788

Dffb, DNA fragmentation factor subunit beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffbO54788 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DffbO54788 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DffbO54788 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DffbO54788 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DffbO54788 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DffbO54788 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DffbO54788 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DffbO54788 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DffbO54788 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DffbO54788 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DffbO54788 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DffbO54788 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DffbO54788 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DffbO54788 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DffbO54788 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DffbO54788 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
DffbO54788 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DffbO54788 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DffbO54788 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DffbO54788 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DffbO54788 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DffbO54788 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DffbO54788 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DffbO54788 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DffbO54788 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
DffbO54788 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DffbO54788 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DffbO54788 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DffbO54788 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DffbO54788 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DffbO54788 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DffbO54788 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DffbO54788 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DffbO54788 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DffbO54788 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DffbO54788 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DffbO54788 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DffbO54788 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DffbO54788 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DffbO54788 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DffbO54788 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DffbO54788 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DffbO54788 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DffbO54788 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DffbO54788 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DffbO54788 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DffbO54788 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DffbO54788 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DffbO54788 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DffbO54788 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DffbO54788 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DffbO54788 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DffbO54788 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DffbO54788 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DffbO54788 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DffbO54788 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DffbO54788 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DffbO54788 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DffbO54788 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DffbO54788 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
DffbO54788 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DffbO54788 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DffbO54788 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DffbO54788 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DffbO54788 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DffbO54788 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DffbO54788 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DffbO54788 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DffbO54788 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DffbO54788 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DffbO54788 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DffbO54788 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DffbO54788 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DffbO54788 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DffbO54788 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DffbO54788 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DffbO54788 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DffbO54788 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DffbO54788 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DffbO54788 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DffbO54788 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DffbO54788 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DffbO54788 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
DffbO54788 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DffbO54788 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DffbO54788 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DffbO54788 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DffbO54788 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DffbO54788 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
DffbO54788 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
DffbO54788 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
DffbO54788 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DffbO54788 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DffbO54788 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
DffbO54788 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
DffbO54788 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
DffbO54788 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
DffbO54788 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DffbO54788 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DffbO54788 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms