Protein–RNA interactions for Protein: O54781

Srpk2, SRSF protein kinase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 681 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srpk2O54781 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Srpk2O54781 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Srpk2O54781 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Srpk2O54781 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Srpk2O54781 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Srpk2O54781 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Srpk2O54781 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Srpk2O54781 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Srpk2O54781 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Srpk2O54781 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Srpk2O54781 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Srpk2O54781 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Srpk2O54781 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Srpk2O54781 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Srpk2O54781 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Srpk2O54781 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Srpk2O54781 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Srpk2O54781 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Srpk2O54781 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Srpk2O54781 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Srpk2O54781 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Srpk2O54781 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Srpk2O54781 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Srpk2O54781 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Srpk2O54781 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Srpk2O54781 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Srpk2O54781 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Srpk2O54781 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Srpk2O54781 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Srpk2O54781 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Srpk2O54781 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Srpk2O54781 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Srpk2O54781 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Srpk2O54781 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Srpk2O54781 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Srpk2O54781 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Srpk2O54781 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Srpk2O54781 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Srpk2O54781 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Srpk2O54781 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Srpk2O54781 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Srpk2O54781 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Srpk2O54781 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Srpk2O54781 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Srpk2O54781 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Srpk2O54781 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Srpk2O54781 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Srpk2O54781 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Srpk2O54781 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Srpk2O54781 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Srpk2O54781 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Srpk2O54781 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Srpk2O54781 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Srpk2O54781 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Srpk2O54781 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Srpk2O54781 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Srpk2O54781 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Srpk2O54781 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Srpk2O54781 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Srpk2O54781 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Srpk2O54781 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Srpk2O54781 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Srpk2O54781 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Srpk2O54781 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Srpk2O54781 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Srpk2O54781 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Srpk2O54781 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Srpk2O54781 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Srpk2O54781 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Srpk2O54781 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Srpk2O54781 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Srpk2O54781 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Srpk2O54781 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Srpk2O54781 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Srpk2O54781 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Srpk2O54781 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Srpk2O54781 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Srpk2O54781 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Srpk2O54781 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Srpk2O54781 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Srpk2O54781 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Srpk2O54781 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Srpk2O54781 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Srpk2O54781 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Srpk2O54781 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Srpk2O54781 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Srpk2O54781 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Srpk2O54781 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Srpk2O54781 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Srpk2O54781 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Srpk2O54781 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Srpk2O54781 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Srpk2O54781 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Srpk2O54781 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Srpk2O54781 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Srpk2O54781 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Srpk2O54781 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Srpk2O54781 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Srpk2O54781 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Srpk2O54781 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms