Protein–RNA interactions for Protein: O54693

Eda, Ectodysplasin-A, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EdaO54693 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EdaO54693 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EdaO54693 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EdaO54693 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EdaO54693 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EdaO54693 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EdaO54693 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EdaO54693 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
EdaO54693 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EdaO54693 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
EdaO54693 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EdaO54693 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
EdaO54693 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EdaO54693 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
EdaO54693 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
EdaO54693 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
EdaO54693 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EdaO54693 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EdaO54693 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EdaO54693 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EdaO54693 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EdaO54693 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EdaO54693 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EdaO54693 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EdaO54693 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EdaO54693 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EdaO54693 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EdaO54693 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EdaO54693 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EdaO54693 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EdaO54693 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EdaO54693 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EdaO54693 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EdaO54693 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
EdaO54693 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EdaO54693 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EdaO54693 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EdaO54693 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
EdaO54693 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EdaO54693 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EdaO54693 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EdaO54693 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EdaO54693 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EdaO54693 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EdaO54693 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EdaO54693 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EdaO54693 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EdaO54693 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EdaO54693 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EdaO54693 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
EdaO54693 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EdaO54693 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EdaO54693 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EdaO54693 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EdaO54693 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EdaO54693 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EdaO54693 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EdaO54693 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EdaO54693 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EdaO54693 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EdaO54693 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EdaO54693 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EdaO54693 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EdaO54693 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EdaO54693 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EdaO54693 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EdaO54693 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EdaO54693 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EdaO54693 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EdaO54693 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EdaO54693 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EdaO54693 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EdaO54693 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EdaO54693 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EdaO54693 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EdaO54693 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EdaO54693 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EdaO54693 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EdaO54693 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EdaO54693 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EdaO54693 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EdaO54693 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EdaO54693 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EdaO54693 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EdaO54693 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EdaO54693 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EdaO54693 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EdaO54693 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EdaO54693 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EdaO54693 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EdaO54693 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
EdaO54693 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EdaO54693 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EdaO54693 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EdaO54693 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EdaO54693 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EdaO54693 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EdaO54693 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EdaO54693 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EdaO54693 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms