Protein–RNA interactions for Protein: O35927

Ctnnd2, Catenin delta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd2O35927 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctnnd2O35927 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ctnnd2O35927 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ctnnd2O35927 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ctnnd2O35927 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ctnnd2O35927 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ctnnd2O35927 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ctnnd2O35927 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ctnnd2O35927 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnnd2O35927 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnnd2O35927 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnnd2O35927 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnnd2O35927 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnnd2O35927 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnnd2O35927 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnnd2O35927 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnnd2O35927 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnnd2O35927 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnnd2O35927 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnnd2O35927 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnnd2O35927 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnnd2O35927 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnnd2O35927 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnnd2O35927 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnnd2O35927 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnnd2O35927 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnnd2O35927 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnnd2O35927 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnnd2O35927 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnnd2O35927 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnnd2O35927 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctnnd2O35927 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctnnd2O35927 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctnnd2O35927 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctnnd2O35927 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctnnd2O35927 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctnnd2O35927 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctnnd2O35927 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctnnd2O35927 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctnnd2O35927 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctnnd2O35927 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctnnd2O35927 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctnnd2O35927 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctnnd2O35927 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctnnd2O35927 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctnnd2O35927 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctnnd2O35927 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctnnd2O35927 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctnnd2O35927 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctnnd2O35927 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms