Protein–RNA interactions for Protein: O35904

Pik3cd, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3cdO35904 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pik3cdO35904 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms