Protein–RNA interactions for Protein: O35864

Cops5, COP9 signalosome complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops5O35864 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cops5O35864 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cops5O35864 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cops5O35864 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cops5O35864 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cops5O35864 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cops5O35864 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cops5O35864 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cops5O35864 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cops5O35864 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cops5O35864 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cops5O35864 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cops5O35864 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cops5O35864 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cops5O35864 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cops5O35864 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cops5O35864 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cops5O35864 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cops5O35864 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cops5O35864 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cops5O35864 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cops5O35864 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cops5O35864 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cops5O35864 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cops5O35864 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cops5O35864 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cops5O35864 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cops5O35864 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cops5O35864 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cops5O35864 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cops5O35864 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cops5O35864 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cops5O35864 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cops5O35864 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cops5O35864 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cops5O35864 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cops5O35864 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cops5O35864 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cops5O35864 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cops5O35864 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cops5O35864 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cops5O35864 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cops5O35864 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cops5O35864 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cops5O35864 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cops5O35864 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cops5O35864 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cops5O35864 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cops5O35864 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cops5O35864 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cops5O35864 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cops5O35864 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cops5O35864 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cops5O35864 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cops5O35864 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cops5O35864 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cops5O35864 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cops5O35864 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cops5O35864 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cops5O35864 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cops5O35864 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cops5O35864 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cops5O35864 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cops5O35864 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cops5O35864 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cops5O35864 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cops5O35864 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cops5O35864 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cops5O35864 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cops5O35864 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cops5O35864 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cops5O35864 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cops5O35864 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cops5O35864 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cops5O35864 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cops5O35864 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cops5O35864 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Cops5O35864 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Cops5O35864 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cops5O35864 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cops5O35864 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cops5O35864 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cops5O35864 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cops5O35864 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cops5O35864 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cops5O35864 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cops5O35864 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cops5O35864 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cops5O35864 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cops5O35864 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cops5O35864 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cops5O35864 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cops5O35864 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cops5O35864 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cops5O35864 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cops5O35864 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cops5O35864 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cops5O35864 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cops5O35864 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cops5O35864 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms