Protein–RNA interactions for Protein: O35709

Enc1, Ectoderm-neural cortex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Enc1O35709 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Enc1O35709 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Enc1O35709 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Enc1O35709 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Enc1O35709 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Enc1O35709 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Enc1O35709 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Enc1O35709 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Enc1O35709 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Enc1O35709 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Enc1O35709 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Enc1O35709 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Enc1O35709 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Enc1O35709 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Enc1O35709 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Enc1O35709 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Enc1O35709 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Enc1O35709 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Enc1O35709 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Enc1O35709 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Enc1O35709 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Enc1O35709 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Enc1O35709 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Enc1O35709 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Enc1O35709 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Enc1O35709 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Enc1O35709 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Enc1O35709 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Enc1O35709 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Enc1O35709 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Enc1O35709 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Enc1O35709 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Enc1O35709 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Enc1O35709 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Enc1O35709 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Enc1O35709 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Enc1O35709 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Enc1O35709 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Enc1O35709 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Enc1O35709 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Enc1O35709 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Enc1O35709 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Enc1O35709 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Enc1O35709 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Enc1O35709 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Enc1O35709 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Enc1O35709 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Enc1O35709 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Enc1O35709 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Enc1O35709 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Enc1O35709 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Enc1O35709 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Enc1O35709 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Enc1O35709 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Enc1O35709 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Enc1O35709 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Enc1O35709 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Enc1O35709 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Enc1O35709 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Enc1O35709 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Enc1O35709 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Enc1O35709 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Enc1O35709 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Enc1O35709 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Enc1O35709 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Enc1O35709 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Enc1O35709 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Enc1O35709 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Enc1O35709 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Enc1O35709 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Enc1O35709 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Enc1O35709 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Enc1O35709 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Enc1O35709 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Enc1O35709 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Enc1O35709 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Enc1O35709 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Enc1O35709 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Enc1O35709 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Enc1O35709 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Enc1O35709 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Enc1O35709 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Enc1O35709 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Enc1O35709 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Enc1O35709 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Enc1O35709 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Enc1O35709 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Enc1O35709 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Enc1O35709 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Enc1O35709 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Enc1O35709 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Enc1O35709 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Enc1O35709 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Enc1O35709 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Enc1O35709 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Enc1O35709 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Enc1O35709 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Enc1O35709 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Enc1O35709 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Enc1O35709 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms