Protein–RNA interactions for Protein: O35685

Nudc, Nuclear migration protein nudC, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NudcO35685 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NudcO35685 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NudcO35685 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NudcO35685 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NudcO35685 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NudcO35685 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NudcO35685 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NudcO35685 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NudcO35685 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NudcO35685 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NudcO35685 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NudcO35685 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NudcO35685 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NudcO35685 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NudcO35685 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NudcO35685 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NudcO35685 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NudcO35685 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NudcO35685 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NudcO35685 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NudcO35685 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NudcO35685 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NudcO35685 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NudcO35685 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NudcO35685 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NudcO35685 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NudcO35685 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NudcO35685 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NudcO35685 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NudcO35685 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NudcO35685 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NudcO35685 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NudcO35685 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NudcO35685 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NudcO35685 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NudcO35685 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NudcO35685 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NudcO35685 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NudcO35685 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NudcO35685 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NudcO35685 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NudcO35685 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NudcO35685 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NudcO35685 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NudcO35685 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NudcO35685 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NudcO35685 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NudcO35685 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NudcO35685 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NudcO35685 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NudcO35685 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NudcO35685 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NudcO35685 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NudcO35685 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NudcO35685 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NudcO35685 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NudcO35685 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NudcO35685 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NudcO35685 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NudcO35685 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NudcO35685 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NudcO35685 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NudcO35685 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NudcO35685 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NudcO35685 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NudcO35685 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NudcO35685 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NudcO35685 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NudcO35685 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NudcO35685 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NudcO35685 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NudcO35685 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
NudcO35685 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NudcO35685 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NudcO35685 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NudcO35685 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NudcO35685 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NudcO35685 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NudcO35685 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NudcO35685 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
NudcO35685 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NudcO35685 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
NudcO35685 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NudcO35685 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NudcO35685 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NudcO35685 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NudcO35685 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NudcO35685 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NudcO35685 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NudcO35685 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NudcO35685 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NudcO35685 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NudcO35685 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NudcO35685 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
NudcO35685 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NudcO35685 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NudcO35685 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NudcO35685 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NudcO35685 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NudcO35685 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms