Protein–RNA interactions for Protein: O35604

Npc1, Niemann-Pick C1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npc1O35604 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Npc1O35604 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Npc1O35604 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Npc1O35604 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Npc1O35604 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Npc1O35604 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Npc1O35604 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Npc1O35604 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Npc1O35604 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Npc1O35604 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Npc1O35604 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Npc1O35604 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Npc1O35604 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Npc1O35604 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Npc1O35604 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Npc1O35604 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Npc1O35604 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Npc1O35604 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Npc1O35604 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Npc1O35604 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Npc1O35604 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Npc1O35604 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Npc1O35604 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Npc1O35604 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Npc1O35604 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Npc1O35604 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Npc1O35604 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Npc1O35604 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Npc1O35604 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Npc1O35604 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Npc1O35604 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Npc1O35604 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Npc1O35604 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Npc1O35604 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Npc1O35604 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Npc1O35604 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Npc1O35604 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Npc1O35604 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Npc1O35604 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Npc1O35604 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Npc1O35604 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Npc1O35604 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Npc1O35604 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Npc1O35604 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Npc1O35604 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Npc1O35604 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Npc1O35604 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Npc1O35604 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Npc1O35604 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Npc1O35604 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Npc1O35604 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Npc1O35604 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Npc1O35604 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Npc1O35604 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Npc1O35604 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Npc1O35604 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Npc1O35604 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Npc1O35604 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Npc1O35604 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Npc1O35604 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Npc1O35604 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Npc1O35604 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Npc1O35604 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Npc1O35604 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Npc1O35604 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Npc1O35604 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Npc1O35604 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Npc1O35604 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Npc1O35604 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Npc1O35604 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Npc1O35604 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Npc1O35604 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Npc1O35604 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Npc1O35604 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Npc1O35604 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Npc1O35604 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Npc1O35604 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Npc1O35604 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Npc1O35604 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Npc1O35604 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Npc1O35604 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Npc1O35604 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Npc1O35604 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Npc1O35604 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Npc1O35604 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Npc1O35604 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Npc1O35604 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Npc1O35604 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Npc1O35604 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Npc1O35604 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Npc1O35604 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Npc1O35604 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Npc1O35604 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Npc1O35604 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Npc1O35604 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Npc1O35604 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Npc1O35604 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Npc1O35604 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Npc1O35604 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Npc1O35604 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.6 ms