Protein–RNA interactions for Protein: O35474

Edil3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edil3O35474 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Edil3O35474 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Edil3O35474 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Edil3O35474 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Edil3O35474 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Edil3O35474 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Edil3O35474 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Edil3O35474 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Edil3O35474 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Edil3O35474 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Edil3O35474 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Edil3O35474 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Edil3O35474 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Edil3O35474 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Edil3O35474 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Edil3O35474 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Edil3O35474 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Edil3O35474 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Edil3O35474 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Edil3O35474 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Edil3O35474 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Edil3O35474 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Edil3O35474 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Edil3O35474 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Edil3O35474 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Edil3O35474 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Edil3O35474 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Edil3O35474 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Edil3O35474 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Edil3O35474 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Edil3O35474 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Edil3O35474 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Edil3O35474 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Edil3O35474 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Edil3O35474 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Edil3O35474 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Edil3O35474 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Edil3O35474 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Edil3O35474 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Edil3O35474 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Edil3O35474 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Edil3O35474 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Edil3O35474 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Edil3O35474 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Edil3O35474 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Edil3O35474 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Edil3O35474 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Edil3O35474 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Edil3O35474 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Edil3O35474 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Edil3O35474 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Edil3O35474 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Edil3O35474 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Edil3O35474 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Edil3O35474 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Edil3O35474 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Edil3O35474 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Edil3O35474 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Edil3O35474 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Edil3O35474 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Edil3O35474 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Edil3O35474 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Edil3O35474 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Edil3O35474 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Edil3O35474 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Edil3O35474 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Edil3O35474 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Edil3O35474 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Edil3O35474 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Edil3O35474 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Edil3O35474 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Edil3O35474 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Edil3O35474 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Edil3O35474 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Edil3O35474 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Edil3O35474 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Edil3O35474 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Edil3O35474 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Edil3O35474 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Edil3O35474 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Edil3O35474 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Edil3O35474 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Edil3O35474 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Edil3O35474 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Edil3O35474 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Edil3O35474 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Edil3O35474 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Edil3O35474 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Edil3O35474 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Edil3O35474 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Edil3O35474 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Edil3O35474 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Edil3O35474 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Edil3O35474 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Edil3O35474 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Edil3O35474 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Edil3O35474 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Edil3O35474 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Edil3O35474 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Edil3O35474 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms