Protein–RNA interactions for Protein: O35326

Srsf5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf5O35326 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms