Protein–RNA interactions for Protein: O35304

Slc18a3, Vesicular acetylcholine transporter, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc18a3O35304 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc18a3O35304 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc18a3O35304 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc18a3O35304 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc18a3O35304 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc18a3O35304 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc18a3O35304 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc18a3O35304 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc18a3O35304 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc18a3O35304 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc18a3O35304 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc18a3O35304 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc18a3O35304 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc18a3O35304 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc18a3O35304 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc18a3O35304 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc18a3O35304 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc18a3O35304 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc18a3O35304 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc18a3O35304 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc18a3O35304 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc18a3O35304 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc18a3O35304 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc18a3O35304 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc18a3O35304 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc18a3O35304 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc18a3O35304 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc18a3O35304 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc18a3O35304 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc18a3O35304 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc18a3O35304 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc18a3O35304 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc18a3O35304 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc18a3O35304 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc18a3O35304 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc18a3O35304 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc18a3O35304 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc18a3O35304 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc18a3O35304 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc18a3O35304 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc18a3O35304 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc18a3O35304 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc18a3O35304 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc18a3O35304 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc18a3O35304 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc18a3O35304 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc18a3O35304 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc18a3O35304 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc18a3O35304 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc18a3O35304 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc18a3O35304 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc18a3O35304 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc18a3O35304 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc18a3O35304 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc18a3O35304 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc18a3O35304 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc18a3O35304 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc18a3O35304 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc18a3O35304 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc18a3O35304 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc18a3O35304 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Slc18a3O35304 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Slc18a3O35304 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Slc18a3O35304 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Slc18a3O35304 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Slc18a3O35304 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Slc18a3O35304 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Slc18a3O35304 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Slc18a3O35304 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Slc18a3O35304 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Slc18a3O35304 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Slc18a3O35304 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Slc18a3O35304 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Slc18a3O35304 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc18a3O35304 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc18a3O35304 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc18a3O35304 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc18a3O35304 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc18a3O35304 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc18a3O35304 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc18a3O35304 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc18a3O35304 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc18a3O35304 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc18a3O35304 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc18a3O35304 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc18a3O35304 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc18a3O35304 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc18a3O35304 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc18a3O35304 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc18a3O35304 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc18a3O35304 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc18a3O35304 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc18a3O35304 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc18a3O35304 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc18a3O35304 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc18a3O35304 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc18a3O35304 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc18a3O35304 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc18a3O35304 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc18a3O35304 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms