Protein–RNA interactions for Protein: O35284

Batf, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BatfO35284 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
BatfO35284 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
BatfO35284 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
BatfO35284 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
BatfO35284 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
BatfO35284 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
BatfO35284 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
BatfO35284 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
BatfO35284 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
BatfO35284 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
BatfO35284 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
BatfO35284 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
BatfO35284 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
BatfO35284 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
BatfO35284 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
BatfO35284 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
BatfO35284 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
BatfO35284 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
BatfO35284 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
BatfO35284 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
BatfO35284 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
BatfO35284 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
BatfO35284 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
BatfO35284 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
BatfO35284 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
BatfO35284 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
BatfO35284 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
BatfO35284 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
BatfO35284 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
BatfO35284 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
BatfO35284 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
BatfO35284 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
BatfO35284 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
BatfO35284 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
BatfO35284 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
BatfO35284 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
BatfO35284 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
BatfO35284 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
BatfO35284 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
BatfO35284 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
BatfO35284 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
BatfO35284 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
BatfO35284 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
BatfO35284 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
BatfO35284 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
BatfO35284 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
BatfO35284 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
BatfO35284 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
BatfO35284 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
BatfO35284 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
BatfO35284 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
BatfO35284 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
BatfO35284 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
BatfO35284 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
BatfO35284 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
BatfO35284 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
BatfO35284 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
BatfO35284 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
BatfO35284 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
BatfO35284 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
BatfO35284 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
BatfO35284 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
BatfO35284 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
BatfO35284 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
BatfO35284 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
BatfO35284 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
BatfO35284 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.52
BatfO35284 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
BatfO35284 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
BatfO35284 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
BatfO35284 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
BatfO35284 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
BatfO35284 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
BatfO35284 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
BatfO35284 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
BatfO35284 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
BatfO35284 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
BatfO35284 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
BatfO35284 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
BatfO35284 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
BatfO35284 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
BatfO35284 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
BatfO35284 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
BatfO35284 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
BatfO35284 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
BatfO35284 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
BatfO35284 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
BatfO35284 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
BatfO35284 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
BatfO35284 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
BatfO35284 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
BatfO35284 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
BatfO35284 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
BatfO35284 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
BatfO35284 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
BatfO35284 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
BatfO35284 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
BatfO35284 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
BatfO35284 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
BatfO35284 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms