Protein–RNA interactions for Protein: O35261

E2f3, Transcription factor E2F3, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f3O35261 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2f3O35261 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2f3O35261 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2f3O35261 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2f3O35261 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
E2f3O35261 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2f3O35261 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2f3O35261 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2f3O35261 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2f3O35261 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2f3O35261 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2f3O35261 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2f3O35261 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2f3O35261 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2f3O35261 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2f3O35261 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2f3O35261 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2f3O35261 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2f3O35261 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2f3O35261 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2f3O35261 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2f3O35261 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2f3O35261 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2f3O35261 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2f3O35261 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
E2f3O35261 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2f3O35261 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2f3O35261 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2f3O35261 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2f3O35261 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2f3O35261 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2f3O35261 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2f3O35261 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2f3O35261 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2f3O35261 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
E2f3O35261 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
E2f3O35261 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
E2f3O35261 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
E2f3O35261 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
E2f3O35261 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
E2f3O35261 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2f3O35261 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2f3O35261 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2f3O35261 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2f3O35261 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2f3O35261 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2f3O35261 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2f3O35261 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2f3O35261 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
E2f3O35261 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2f3O35261 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
E2f3O35261 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
E2f3O35261 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
E2f3O35261 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
E2f3O35261 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2f3O35261 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2f3O35261 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2f3O35261 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2f3O35261 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
E2f3O35261 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2f3O35261 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2f3O35261 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2f3O35261 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2f3O35261 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2f3O35261 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2f3O35261 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2f3O35261 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2f3O35261 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2f3O35261 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2f3O35261 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2f3O35261 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2f3O35261 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2f3O35261 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
E2f3O35261 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2f3O35261 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
E2f3O35261 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2f3O35261 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2f3O35261 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2f3O35261 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2f3O35261 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2f3O35261 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2f3O35261 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2f3O35261 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2f3O35261 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2f3O35261 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2f3O35261 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2f3O35261 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2f3O35261 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2f3O35261 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2f3O35261 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2f3O35261 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2f3O35261 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2f3O35261 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2f3O35261 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2f3O35261 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2f3O35261 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2f3O35261 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2f3O35261 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2f3O35261 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2f3O35261 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms