Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

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Length 593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
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Ptpn9O35239 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ptpn9O35239 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ptpn9O35239 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ptpn9O35239 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ptpn9O35239 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ptpn9O35239 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ptpn9O35239 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ptpn9O35239 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ptpn9O35239 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ptpn9O35239 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ptpn9O35239 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ptpn9O35239 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ptpn9O35239 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ptpn9O35239 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ptpn9O35239 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ptpn9O35239 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ptpn9O35239 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ptpn9O35239 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ptpn9O35239 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ptpn9O35239 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ptpn9O35239 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ptpn9O35239 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
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Ptpn9O35239 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ptpn9O35239 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ptpn9O35239 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptpn9O35239 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptpn9O35239 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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Ptpn9O35239 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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Ptpn9O35239 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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Ptpn9O35239 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptpn9O35239 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptpn9O35239 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptpn9O35239 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptpn9O35239 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptpn9O35239 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptpn9O35239 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptpn9O35239 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptpn9O35239 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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Ptpn9O35239 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptpn9O35239 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptpn9O35239 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptpn9O35239 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptpn9O35239 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptpn9O35239 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptpn9O35239 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptpn9O35239 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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Ptpn9O35239 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptpn9O35239 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptpn9O35239 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptpn9O35239 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptpn9O35239 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptpn9O35239 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptpn9O35239 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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Ptpn9O35239 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptpn9O35239 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
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