Protein–RNA interactions for Protein: O35182

Smad6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad6O35182 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smad6O35182 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smad6O35182 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smad6O35182 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smad6O35182 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smad6O35182 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smad6O35182 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smad6O35182 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smad6O35182 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smad6O35182 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smad6O35182 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smad6O35182 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Smad6O35182 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Smad6O35182 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smad6O35182 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smad6O35182 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smad6O35182 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smad6O35182 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smad6O35182 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smad6O35182 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smad6O35182 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smad6O35182 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smad6O35182 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smad6O35182 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smad6O35182 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smad6O35182 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smad6O35182 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smad6O35182 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smad6O35182 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smad6O35182 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smad6O35182 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smad6O35182 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smad6O35182 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smad6O35182 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smad6O35182 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smad6O35182 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smad6O35182 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smad6O35182 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smad6O35182 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smad6O35182 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smad6O35182 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smad6O35182 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smad6O35182 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smad6O35182 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smad6O35182 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smad6O35182 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smad6O35182 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smad6O35182 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smad6O35182 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smad6O35182 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smad6O35182 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smad6O35182 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smad6O35182 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smad6O35182 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smad6O35182 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smad6O35182 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smad6O35182 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smad6O35182 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smad6O35182 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smad6O35182 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smad6O35182 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smad6O35182 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smad6O35182 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smad6O35182 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smad6O35182 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smad6O35182 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smad6O35182 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smad6O35182 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smad6O35182 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smad6O35182 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Smad6O35182 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smad6O35182 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smad6O35182 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smad6O35182 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smad6O35182 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smad6O35182 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smad6O35182 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smad6O35182 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smad6O35182 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smad6O35182 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smad6O35182 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smad6O35182 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smad6O35182 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smad6O35182 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Smad6O35182 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Smad6O35182 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smad6O35182 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smad6O35182 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smad6O35182 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smad6O35182 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smad6O35182 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smad6O35182 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smad6O35182 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smad6O35182 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smad6O35182 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smad6O35182 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smad6O35182 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smad6O35182 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Smad6O35182 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smad6O35182 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms