Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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Nedd9O35177 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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Nedd9O35177 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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Nedd9O35177 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nedd9O35177 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nedd9O35177 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
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Nedd9O35177 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nedd9O35177 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nedd9O35177 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nedd9O35177 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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Nedd9O35177 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nedd9O35177 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nedd9O35177 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nedd9O35177 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nedd9O35177 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nedd9O35177 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nedd9O35177 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nedd9O35177 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Nedd9O35177 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Nedd9O35177 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nedd9O35177 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
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