Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Casq1O09165 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Casq1O09165 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Casq1O09165 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Casq1O09165 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Casq1O09165 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Casq1O09165 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Casq1O09165 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Casq1O09165 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Casq1O09165 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Casq1O09165 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Casq1O09165 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Casq1O09165 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Casq1O09165 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Casq1O09165 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Casq1O09165 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Casq1O09165 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Casq1O09165 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Casq1O09165 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Casq1O09165 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Casq1O09165 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Casq1O09165 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Casq1O09165 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Casq1O09165 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Casq1O09165 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Casq1O09165 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Casq1O09165 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Casq1O09165 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Casq1O09165 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Casq1O09165 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Casq1O09165 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Casq1O09165 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Casq1O09165 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Casq1O09165 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Casq1O09165 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Casq1O09165 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Casq1O09165 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Casq1O09165 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Casq1O09165 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Casq1O09165 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Casq1O09165 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Casq1O09165 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Casq1O09165 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Casq1O09165 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Casq1O09165 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Casq1O09165 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Casq1O09165 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Casq1O09165 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Casq1O09165 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Casq1O09165 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Casq1O09165 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Casq1O09165 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Casq1O09165 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Casq1O09165 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Casq1O09165 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Casq1O09165 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Casq1O09165 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Casq1O09165 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Casq1O09165 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Casq1O09165 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Casq1O09165 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Casq1O09165 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Casq1O09165 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Casq1O09165 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Casq1O09165 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Casq1O09165 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Casq1O09165 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Casq1O09165 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Casq1O09165 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Casq1O09165 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Casq1O09165 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Casq1O09165 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Casq1O09165 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Casq1O09165 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Casq1O09165 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Casq1O09165 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Casq1O09165 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Casq1O09165 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Casq1O09165 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Casq1O09165 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Casq1O09165 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Casq1O09165 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Casq1O09165 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Casq1O09165 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Casq1O09165 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Casq1O09165 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Casq1O09165 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Casq1O09165 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Casq1O09165 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Casq1O09165 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Casq1O09165 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Casq1O09165 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Casq1O09165 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Casq1O09165 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Casq1O09165 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Casq1O09165 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Casq1O09165 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Casq1O09165 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Casq1O09165 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Casq1O09165 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms