Protein–RNA interactions for Protein: O09044

Snap23, Synaptosomal-associated protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap23O09044 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Snap23O09044 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snap23O09044 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snap23O09044 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snap23O09044 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snap23O09044 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snap23O09044 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snap23O09044 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snap23O09044 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snap23O09044 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snap23O09044 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snap23O09044 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snap23O09044 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snap23O09044 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snap23O09044 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snap23O09044 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snap23O09044 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snap23O09044 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Snap23O09044 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snap23O09044 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snap23O09044 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snap23O09044 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snap23O09044 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snap23O09044 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snap23O09044 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snap23O09044 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snap23O09044 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snap23O09044 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snap23O09044 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snap23O09044 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snap23O09044 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snap23O09044 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snap23O09044 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snap23O09044 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snap23O09044 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snap23O09044 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snap23O09044 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snap23O09044 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snap23O09044 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snap23O09044 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snap23O09044 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snap23O09044 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snap23O09044 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snap23O09044 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snap23O09044 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snap23O09044 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snap23O09044 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snap23O09044 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snap23O09044 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snap23O09044 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snap23O09044 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snap23O09044 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snap23O09044 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snap23O09044 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snap23O09044 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snap23O09044 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snap23O09044 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snap23O09044 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snap23O09044 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snap23O09044 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snap23O09044 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snap23O09044 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snap23O09044 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snap23O09044 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snap23O09044 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snap23O09044 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snap23O09044 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snap23O09044 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snap23O09044 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snap23O09044 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snap23O09044 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snap23O09044 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snap23O09044 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Snap23O09044 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snap23O09044 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snap23O09044 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snap23O09044 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snap23O09044 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snap23O09044 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snap23O09044 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snap23O09044 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snap23O09044 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snap23O09044 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snap23O09044 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snap23O09044 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snap23O09044 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snap23O09044 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snap23O09044 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snap23O09044 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snap23O09044 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snap23O09044 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snap23O09044 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snap23O09044 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snap23O09044 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snap23O09044 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Snap23O09044 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snap23O09044 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snap23O09044 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snap23O09044 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snap23O09044 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms