Protein–RNA interactions for Protein: O08966

Slc22a1, Solute carrier family 22 member 1, mousemouse

Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a1O08966 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc22a1O08966 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc22a1O08966 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc22a1O08966 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc22a1O08966 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc22a1O08966 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc22a1O08966 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc22a1O08966 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc22a1O08966 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc22a1O08966 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc22a1O08966 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc22a1O08966 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc22a1O08966 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc22a1O08966 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc22a1O08966 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc22a1O08966 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc22a1O08966 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slc22a1O08966 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slc22a1O08966 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slc22a1O08966 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slc22a1O08966 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc22a1O08966 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc22a1O08966 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc22a1O08966 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc22a1O08966 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc22a1O08966 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc22a1O08966 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc22a1O08966 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc22a1O08966 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc22a1O08966 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc22a1O08966 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc22a1O08966 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc22a1O08966 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc22a1O08966 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc22a1O08966 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc22a1O08966 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc22a1O08966 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc22a1O08966 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc22a1O08966 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc22a1O08966 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc22a1O08966 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc22a1O08966 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc22a1O08966 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc22a1O08966 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc22a1O08966 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc22a1O08966 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc22a1O08966 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc22a1O08966 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc22a1O08966 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc22a1O08966 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc22a1O08966 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc22a1O08966 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc22a1O08966 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc22a1O08966 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc22a1O08966 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc22a1O08966 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc22a1O08966 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc22a1O08966 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc22a1O08966 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc22a1O08966 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc22a1O08966 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc22a1O08966 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc22a1O08966 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc22a1O08966 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc22a1O08966 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc22a1O08966 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc22a1O08966 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc22a1O08966 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc22a1O08966 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc22a1O08966 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc22a1O08966 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc22a1O08966 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc22a1O08966 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc22a1O08966 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc22a1O08966 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc22a1O08966 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc22a1O08966 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc22a1O08966 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc22a1O08966 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc22a1O08966 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc22a1O08966 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc22a1O08966 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc22a1O08966 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc22a1O08966 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc22a1O08966 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc22a1O08966 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc22a1O08966 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc22a1O08966 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc22a1O08966 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc22a1O08966 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc22a1O08966 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc22a1O08966 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc22a1O08966 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc22a1O08966 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc22a1O08966 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc22a1O08966 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc22a1O08966 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc22a1O08966 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc22a1O08966 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc22a1O08966 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms