Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MsmbO08540 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC13□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MsmbO08540 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC13□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
MsmbO08540 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
MsmbO08540 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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MsmbO08540 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
MsmbO08540 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
MsmbO08540 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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