Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm20939L7N243 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm20939L7N243 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm20939L7N243 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm20939L7N243 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm20939L7N243 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm20939L7N243 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm20939L7N243 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm20939L7N243 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm20939L7N243 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm20939L7N243 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm20939L7N243 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm20939L7N243 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm20939L7N243 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm20939L7N243 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm20939L7N243 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20939L7N243 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20939L7N243 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20939L7N243 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20939L7N243 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20939L7N243 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20939L7N243 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20939L7N243 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20939L7N243 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20939L7N243 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20939L7N243 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20939L7N243 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20939L7N243 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20939L7N243 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20939L7N243 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20939L7N243 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20939L7N243 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20939L7N243 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20939L7N243 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20939L7N243 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20939L7N243 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20939L7N243 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20939L7N243 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20939L7N243 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20939L7N243 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20939L7N243 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20939L7N243 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20939L7N243 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20939L7N243 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20939L7N243 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20939L7N243 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20939L7N243 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20939L7N243 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20939L7N243 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20939L7N243 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms