Protein–RNA interactions for Protein: J3QPX5

Gm8888, Predicted gene 8888, mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8888J3QPX5 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Gm8888J3QPX5 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm8888J3QPX5 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm8888J3QPX5 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm8888J3QPX5 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm8888J3QPX5 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm8888J3QPX5 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm8888J3QPX5 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm8888J3QPX5 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm8888J3QPX5 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm8888J3QPX5 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm8888J3QPX5 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm8888J3QPX5 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm8888J3QPX5 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm8888J3QPX5 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm8888J3QPX5 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm8888J3QPX5 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm8888J3QPX5 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm8888J3QPX5 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm8888J3QPX5 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm8888J3QPX5 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm8888J3QPX5 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm8888J3QPX5 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm8888J3QPX5 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm8888J3QPX5 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm8888J3QPX5 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm8888J3QPX5 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm8888J3QPX5 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm8888J3QPX5 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm8888J3QPX5 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm8888J3QPX5 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm8888J3QPX5 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm8888J3QPX5 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm8888J3QPX5 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm8888J3QPX5 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm8888J3QPX5 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm8888J3QPX5 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm8888J3QPX5 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Gm8888J3QPX5 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm8888J3QPX5 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm8888J3QPX5 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm8888J3QPX5 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm8888J3QPX5 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm8888J3QPX5 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm8888J3QPX5 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm8888J3QPX5 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm8888J3QPX5 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm8888J3QPX5 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm8888J3QPX5 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm8888J3QPX5 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Gm8888J3QPX5 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm8888J3QPX5 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm8888J3QPX5 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm8888J3QPX5 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm8888J3QPX5 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Gm8888J3QPX5 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Gm8888J3QPX5 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm8888J3QPX5 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Gm8888J3QPX5 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Gm8888J3QPX5 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8888J3QPX5 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8888J3QPX5 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8888J3QPX5 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8888J3QPX5 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8888J3QPX5 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8888J3QPX5 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8888J3QPX5 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8888J3QPX5 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8888J3QPX5 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8888J3QPX5 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8888J3QPX5 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Gm8888J3QPX5 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Gm8888J3QPX5 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Gm8888J3QPX5 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Gm8888J3QPX5 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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