Protein–RNA interactions for Protein: J3QNN2

Gm21976, Predicted gene 21976, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21976J3QNN2 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm21976J3QNN2 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm21976J3QNN2 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm21976J3QNN2 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm21976J3QNN2 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm21976J3QNN2 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm21976J3QNN2 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Gm21976J3QNN2 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Gm21976J3QNN2 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm21976J3QNN2 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm21976J3QNN2 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm21976J3QNN2 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm21976J3QNN2 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm21976J3QNN2 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
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Gm21976J3QNN2 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm21976J3QNN2 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
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Gm21976J3QNN2 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Gm21976J3QNN2 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Gm21976J3QNN2 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm21976J3QNN2 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm21976J3QNN2 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm21976J3QNN2 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21976J3QNN2 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21976J3QNN2 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21976J3QNN2 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Gm21976J3QNN2 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21976J3QNN2 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21976J3QNN2 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21976J3QNN2 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Gm21976J3QNN2 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21976J3QNN2 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21976J3QNN2 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21976J3QNN2 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21976J3QNN2 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21976J3QNN2 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Gm21976J3QNN2 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm21976J3QNN2 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm21976J3QNN2 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm21976J3QNN2 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Gm21976J3QNN2 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm21976J3QNN2 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm21976J3QNN2 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Gm21976J3QNN2 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm21976J3QNN2 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm21976J3QNN2 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Gm21976J3QNN2 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21976J3QNN2 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21976J3QNN2 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21976J3QNN2 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21976J3QNN2 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Gm21976J3QNN2 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Gm21976J3QNN2 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21976J3QNN2 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21976J3QNN2 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21976J3QNN2 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21976J3QNN2 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21976J3QNN2 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21976J3QNN2 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21976J3QNN2 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21976J3QNN2 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21976J3QNN2 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21976J3QNN2 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21976J3QNN2 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21976J3QNN2 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21976J3QNN2 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21976J3QNN2 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21976J3QNN2 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21976J3QNN2 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21976J3QNN2 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21976J3QNN2 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21976J3QNN2 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms