Protein–RNA interactions for Protein: J3QNM1

Cldn34c2, Claudin 34C2, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c2J3QNM1 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cldn34c2J3QNM1 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn34c2J3QNM1 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn34c2J3QNM1 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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