Protein–RNA interactions for Protein: J3QN84

Gm21812, Predicted gene, 21812, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21812J3QN84 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21812J3QN84 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21812J3QN84 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21812J3QN84 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21812J3QN84 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21812J3QN84 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21812J3QN84 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21812J3QN84 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21812J3QN84 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21812J3QN84 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21812J3QN84 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21812J3QN84 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21812J3QN84 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21812J3QN84 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21812J3QN84 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21812J3QN84 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21812J3QN84 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21812J3QN84 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21812J3QN84 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21812J3QN84 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21812J3QN84 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21812J3QN84 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21812J3QN84 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21812J3QN84 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21812J3QN84 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21812J3QN84 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21812J3QN84 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21812J3QN84 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21812J3QN84 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21812J3QN84 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21812J3QN84 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21812J3QN84 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21812J3QN84 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21812J3QN84 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21812J3QN84 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21812J3QN84 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21812J3QN84 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21812J3QN84 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21812J3QN84 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21812J3QN84 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21812J3QN84 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21812J3QN84 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21812J3QN84 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21812J3QN84 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21812J3QN84 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21812J3QN84 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21812J3QN84 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21812J3QN84 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21812J3QN84 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21812J3QN84 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21812J3QN84 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21812J3QN84 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21812J3QN84 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21812J3QN84 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21812J3QN84 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21812J3QN84 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21812J3QN84 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21812J3QN84 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21812J3QN84 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21812J3QN84 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21812J3QN84 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21812J3QN84 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21812J3QN84 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21812J3QN84 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21812J3QN84 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21812J3QN84 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21812J3QN84 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21812J3QN84 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21812J3QN84 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21812J3QN84 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21812J3QN84 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21812J3QN84 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21812J3QN84 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21812J3QN84 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21812J3QN84 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21812J3QN84 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21812J3QN84 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21812J3QN84 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21812J3QN84 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21812J3QN84 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21812J3QN84 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21812J3QN84 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21812J3QN84 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21812J3QN84 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21812J3QN84 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21812J3QN84 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21812J3QN84 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21812J3QN84 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21812J3QN84 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21812J3QN84 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21812J3QN84 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21812J3QN84 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm21812J3QN84 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm21812J3QN84 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm21812J3QN84 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm21812J3QN84 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm21812J3QN84 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm21812J3QN84 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm21812J3QN84 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm21812J3QN84 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 167.1 ms