Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS2

1700014D04Rik, MCG148436, mousemouse

Predictions only

Length 983 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700014D04RikJ3QMS2 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms