Protein–RNA interactions for Protein: J3QM67

Gm20825, Predicted gene, 20825, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20825J3QM67 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20825J3QM67 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20825J3QM67 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20825J3QM67 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20825J3QM67 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20825J3QM67 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20825J3QM67 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20825J3QM67 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20825J3QM67 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20825J3QM67 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20825J3QM67 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20825J3QM67 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20825J3QM67 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20825J3QM67 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20825J3QM67 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20825J3QM67 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20825J3QM67 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20825J3QM67 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20825J3QM67 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20825J3QM67 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20825J3QM67 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20825J3QM67 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20825J3QM67 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20825J3QM67 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20825J3QM67 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20825J3QM67 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20825J3QM67 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20825J3QM67 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20825J3QM67 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20825J3QM67 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20825J3QM67 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20825J3QM67 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20825J3QM67 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20825J3QM67 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20825J3QM67 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20825J3QM67 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20825J3QM67 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20825J3QM67 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20825J3QM67 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20825J3QM67 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20825J3QM67 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20825J3QM67 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20825J3QM67 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20825J3QM67 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20825J3QM67 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20825J3QM67 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20825J3QM67 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20825J3QM67 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20825J3QM67 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20825J3QM67 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20825J3QM67 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20825J3QM67 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20825J3QM67 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20825J3QM67 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20825J3QM67 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20825J3QM67 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20825J3QM67 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20825J3QM67 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20825J3QM67 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20825J3QM67 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20825J3QM67 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20825J3QM67 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20825J3QM67 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20825J3QM67 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20825J3QM67 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20825J3QM67 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20825J3QM67 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20825J3QM67 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20825J3QM67 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20825J3QM67 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20825J3QM67 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20825J3QM67 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20825J3QM67 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20825J3QM67 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm20825J3QM67 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm20825J3QM67 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm20825J3QM67 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm20825J3QM67 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm20825J3QM67 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm20825J3QM67 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm20825J3QM67 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm20825J3QM67 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20825J3QM67 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20825J3QM67 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20825J3QM67 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20825J3QM67 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20825J3QM67 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20825J3QM67 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20825J3QM67 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20825J3QM67 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20825J3QM67 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20825J3QM67 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20825J3QM67 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20825J3QM67 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20825J3QM67 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20825J3QM67 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20825J3QM67 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20825J3QM67 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20825J3QM67 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20825J3QM67 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms