Protein–RNA interactions for Protein: J3QK56

4930544D05Rik, RIKEN cDNA 4930544D05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544D05RikJ3QK56 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4930544D05RikJ3QK56 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4930544D05RikJ3QK56 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4930544D05RikJ3QK56 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
4930544D05RikJ3QK56 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
4930544D05RikJ3QK56 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4930544D05RikJ3QK56 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4930544D05RikJ3QK56 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
4930544D05RikJ3QK56 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4930544D05RikJ3QK56 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms