Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm20830J3KML6 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm20830J3KML6 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm20830J3KML6 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm20830J3KML6 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm20830J3KML6 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm20830J3KML6 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm20830J3KML6 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm20830J3KML6 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm20830J3KML6 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm20830J3KML6 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm20830J3KML6 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm20830J3KML6 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm20830J3KML6 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm20830J3KML6 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm20830J3KML6 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm20830J3KML6 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm20830J3KML6 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm20830J3KML6 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm20830J3KML6 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm20830J3KML6 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm20830J3KML6 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm20830J3KML6 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm20830J3KML6 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm20830J3KML6 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm20830J3KML6 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm20830J3KML6 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm20830J3KML6 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm20830J3KML6 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm20830J3KML6 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm20830J3KML6 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm20830J3KML6 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm20830J3KML6 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm20830J3KML6 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20830J3KML6 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20830J3KML6 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20830J3KML6 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20830J3KML6 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20830J3KML6 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20830J3KML6 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20830J3KML6 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20830J3KML6 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20830J3KML6 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20830J3KML6 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20830J3KML6 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20830J3KML6 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20830J3KML6 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20830J3KML6 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20830J3KML6 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20830J3KML6 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20830J3KML6 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20830J3KML6 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20830J3KML6 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20830J3KML6 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20830J3KML6 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20830J3KML6 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20830J3KML6 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20830J3KML6 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20830J3KML6 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20830J3KML6 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20830J3KML6 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20830J3KML6 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20830J3KML6 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20830J3KML6 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20830J3KML6 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20830J3KML6 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20830J3KML6 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20830J3KML6 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20830J3KML6 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20830J3KML6 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20830J3KML6 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20830J3KML6 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20830J3KML6 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20830J3KML6 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20830J3KML6 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20830J3KML6 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20830J3KML6 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20830J3KML6 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20830J3KML6 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20830J3KML6 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20830J3KML6 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20830J3KML6 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20830J3KML6 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20830J3KML6 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20830J3KML6 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm20830J3KML6 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm20830J3KML6 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm20830J3KML6 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm20830J3KML6 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm20830J3KML6 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms