Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X0

Cldn20, Claudin, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn20G5E8X0 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn20G5E8X0 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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