Protein–RNA interactions for Protein: G3XA12

4933406M09Rik, RIKEN cDNA 4933406M09, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933406M09RikG3XA12 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
4933406M09RikG3XA12 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4933406M09RikG3XA12 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4933406M09RikG3XA12 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
4933406M09RikG3XA12 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
4933406M09RikG3XA12 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4933406M09RikG3XA12 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4933406M09RikG3XA12 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4933406M09RikG3XA12 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4933406M09RikG3XA12 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
4933406M09RikG3XA12 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4933406M09RikG3XA12 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4933406M09RikG3XA12 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4933406M09RikG3XA12 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4933406M09RikG3XA12 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4933406M09RikG3XA12 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
4933406M09RikG3XA12 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4933406M09RikG3XA12 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4933406M09RikG3XA12 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4933406M09RikG3XA12 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4933406M09RikG3XA12 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4933406M09RikG3XA12 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4933406M09RikG3XA12 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
4933406M09RikG3XA12 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
4933406M09RikG3XA12 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
4933406M09RikG3XA12 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
4933406M09RikG3XA12 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
4933406M09RikG3XA12 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4933406M09RikG3XA12 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4933406M09RikG3XA12 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4933406M09RikG3XA12 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4933406M09RikG3XA12 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4933406M09RikG3XA12 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4933406M09RikG3XA12 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
4933406M09RikG3XA12 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4933406M09RikG3XA12 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4933406M09RikG3XA12 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
4933406M09RikG3XA12 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4933406M09RikG3XA12 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
4933406M09RikG3XA12 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4933406M09RikG3XA12 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4933406M09RikG3XA12 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
4933406M09RikG3XA12 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4933406M09RikG3XA12 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4933406M09RikG3XA12 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4933406M09RikG3XA12 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4933406M09RikG3XA12 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
4933406M09RikG3XA12 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4933406M09RikG3XA12 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4933406M09RikG3XA12 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4933406M09RikG3XA12 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
4933406M09RikG3XA12 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4933406M09RikG3XA12 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4933406M09RikG3XA12 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4933406M09RikG3XA12 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4933406M09RikG3XA12 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
4933406M09RikG3XA12 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
4933406M09RikG3XA12 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
4933406M09RikG3XA12 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
4933406M09RikG3XA12 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
4933406M09RikG3XA12 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4933406M09RikG3XA12 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4933406M09RikG3XA12 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4933406M09RikG3XA12 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4933406M09RikG3XA12 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
4933406M09RikG3XA12 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4933406M09RikG3XA12 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4933406M09RikG3XA12 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4933406M09RikG3XA12 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
4933406M09RikG3XA12 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4933406M09RikG3XA12 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
4933406M09RikG3XA12 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
4933406M09RikG3XA12 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4933406M09RikG3XA12 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
4933406M09RikG3XA12 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4933406M09RikG3XA12 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
4933406M09RikG3XA12 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4933406M09RikG3XA12 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4933406M09RikG3XA12 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
4933406M09RikG3XA12 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4933406M09RikG3XA12 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4933406M09RikG3XA12 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4933406M09RikG3XA12 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4933406M09RikG3XA12 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
4933406M09RikG3XA12 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4933406M09RikG3XA12 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
4933406M09RikG3XA12 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4933406M09RikG3XA12 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4933406M09RikG3XA12 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
4933406M09RikG3XA12 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4933406M09RikG3XA12 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
4933406M09RikG3XA12 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
4933406M09RikG3XA12 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4933406M09RikG3XA12 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
4933406M09RikG3XA12 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
4933406M09RikG3XA12 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
4933406M09RikG3XA12 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4933406M09RikG3XA12 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
4933406M09RikG3XA12 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4933406M09RikG3XA12 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms