Protein–RNA interactions for Protein: G3X9F6

Sh3tc1, SH3 domain and tetratricopeptide repeats 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3tc1G3X9F6 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sh3tc1G3X9F6 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Sh3tc1G3X9F6 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sh3tc1G3X9F6 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sh3tc1G3X9F6 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sh3tc1G3X9F6 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sh3tc1G3X9F6 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sh3tc1G3X9F6 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sh3tc1G3X9F6 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sh3tc1G3X9F6 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sh3tc1G3X9F6 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sh3tc1G3X9F6 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sh3tc1G3X9F6 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sh3tc1G3X9F6 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sh3tc1G3X9F6 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sh3tc1G3X9F6 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sh3tc1G3X9F6 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sh3tc1G3X9F6 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sh3tc1G3X9F6 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sh3tc1G3X9F6 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sh3tc1G3X9F6 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sh3tc1G3X9F6 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sh3tc1G3X9F6 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sh3tc1G3X9F6 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sh3tc1G3X9F6 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sh3tc1G3X9F6 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Sh3tc1G3X9F6 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sh3tc1G3X9F6 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Sh3tc1G3X9F6 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sh3tc1G3X9F6 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Sh3tc1G3X9F6 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sh3tc1G3X9F6 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sh3tc1G3X9F6 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sh3tc1G3X9F6 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sh3tc1G3X9F6 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sh3tc1G3X9F6 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sh3tc1G3X9F6 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sh3tc1G3X9F6 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sh3tc1G3X9F6 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sh3tc1G3X9F6 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sh3tc1G3X9F6 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sh3tc1G3X9F6 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sh3tc1G3X9F6 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Sh3tc1G3X9F6 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Sh3tc1G3X9F6 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sh3tc1G3X9F6 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sh3tc1G3X9F6 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sh3tc1G3X9F6 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sh3tc1G3X9F6 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sh3tc1G3X9F6 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sh3tc1G3X9F6 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sh3tc1G3X9F6 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sh3tc1G3X9F6 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sh3tc1G3X9F6 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sh3tc1G3X9F6 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sh3tc1G3X9F6 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sh3tc1G3X9F6 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sh3tc1G3X9F6 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sh3tc1G3X9F6 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Sh3tc1G3X9F6 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sh3tc1G3X9F6 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sh3tc1G3X9F6 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sh3tc1G3X9F6 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sh3tc1G3X9F6 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sh3tc1G3X9F6 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sh3tc1G3X9F6 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sh3tc1G3X9F6 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sh3tc1G3X9F6 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sh3tc1G3X9F6 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sh3tc1G3X9F6 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sh3tc1G3X9F6 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sh3tc1G3X9F6 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sh3tc1G3X9F6 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sh3tc1G3X9F6 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sh3tc1G3X9F6 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sh3tc1G3X9F6 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sh3tc1G3X9F6 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Sh3tc1G3X9F6 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sh3tc1G3X9F6 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sh3tc1G3X9F6 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sh3tc1G3X9F6 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sh3tc1G3X9F6 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sh3tc1G3X9F6 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sh3tc1G3X9F6 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sh3tc1G3X9F6 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sh3tc1G3X9F6 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sh3tc1G3X9F6 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sh3tc1G3X9F6 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sh3tc1G3X9F6 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sh3tc1G3X9F6 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sh3tc1G3X9F6 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sh3tc1G3X9F6 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sh3tc1G3X9F6 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sh3tc1G3X9F6 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sh3tc1G3X9F6 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sh3tc1G3X9F6 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sh3tc1G3X9F6 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sh3tc1G3X9F6 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sh3tc1G3X9F6 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sh3tc1G3X9F6 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms