Protein–RNA interactions for Protein: G3X939

Slc9a3, Sodium/hydrogen exchanger 3, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a3G3X939 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc9a3G3X939 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc9a3G3X939 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc9a3G3X939 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc9a3G3X939 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc9a3G3X939 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc9a3G3X939 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc9a3G3X939 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc9a3G3X939 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc9a3G3X939 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc9a3G3X939 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc9a3G3X939 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc9a3G3X939 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc9a3G3X939 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc9a3G3X939 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc9a3G3X939 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc9a3G3X939 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc9a3G3X939 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc9a3G3X939 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc9a3G3X939 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc9a3G3X939 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc9a3G3X939 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc9a3G3X939 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc9a3G3X939 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc9a3G3X939 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc9a3G3X939 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc9a3G3X939 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc9a3G3X939 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc9a3G3X939 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc9a3G3X939 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc9a3G3X939 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc9a3G3X939 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc9a3G3X939 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc9a3G3X939 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc9a3G3X939 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc9a3G3X939 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc9a3G3X939 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc9a3G3X939 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc9a3G3X939 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc9a3G3X939 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc9a3G3X939 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc9a3G3X939 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Slc9a3G3X939 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Slc9a3G3X939 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Slc9a3G3X939 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Slc9a3G3X939 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Slc9a3G3X939 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Slc9a3G3X939 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Slc9a3G3X939 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Slc9a3G3X939 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Slc9a3G3X939 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Slc9a3G3X939 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc9a3G3X939 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc9a3G3X939 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc9a3G3X939 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc9a3G3X939 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc9a3G3X939 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc9a3G3X939 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc9a3G3X939 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc9a3G3X939 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc9a3G3X939 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc9a3G3X939 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc9a3G3X939 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc9a3G3X939 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc9a3G3X939 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc9a3G3X939 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc9a3G3X939 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc9a3G3X939 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc9a3G3X939 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc9a3G3X939 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc9a3G3X939 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc9a3G3X939 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc9a3G3X939 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc9a3G3X939 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc9a3G3X939 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc9a3G3X939 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc9a3G3X939 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc9a3G3X939 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc9a3G3X939 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc9a3G3X939 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc9a3G3X939 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc9a3G3X939 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc9a3G3X939 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc9a3G3X939 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc9a3G3X939 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc9a3G3X939 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc9a3G3X939 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc9a3G3X939 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc9a3G3X939 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc9a3G3X939 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc9a3G3X939 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc9a3G3X939 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc9a3G3X939 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc9a3G3X939 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc9a3G3X939 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc9a3G3X939 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc9a3G3X939 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc9a3G3X939 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc9a3G3X939 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc9a3G3X939 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms