Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ5

Ercc6, Excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6F8VPZ5 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ercc6F8VPZ5 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ercc6F8VPZ5 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ercc6F8VPZ5 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ercc6F8VPZ5 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Ercc6F8VPZ5 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ercc6F8VPZ5 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ercc6F8VPZ5 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ercc6F8VPZ5 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ercc6F8VPZ5 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Ercc6F8VPZ5 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ercc6F8VPZ5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ercc6F8VPZ5 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ercc6F8VPZ5 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ercc6F8VPZ5 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ercc6F8VPZ5 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ercc6F8VPZ5 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ercc6F8VPZ5 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ercc6F8VPZ5 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ercc6F8VPZ5 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ercc6F8VPZ5 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ercc6F8VPZ5 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ercc6F8VPZ5 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ercc6F8VPZ5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ercc6F8VPZ5 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ercc6F8VPZ5 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ercc6F8VPZ5 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Ercc6F8VPZ5 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ercc6F8VPZ5 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ercc6F8VPZ5 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ercc6F8VPZ5 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ercc6F8VPZ5 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ercc6F8VPZ5 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ercc6F8VPZ5 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ercc6F8VPZ5 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ercc6F8VPZ5 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ercc6F8VPZ5 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Ercc6F8VPZ5 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ercc6F8VPZ5 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ercc6F8VPZ5 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ercc6F8VPZ5 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ercc6F8VPZ5 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ercc6F8VPZ5 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ercc6F8VPZ5 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ercc6F8VPZ5 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ercc6F8VPZ5 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ercc6F8VPZ5 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ercc6F8VPZ5 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ercc6F8VPZ5 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ercc6F8VPZ5 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ercc6F8VPZ5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ercc6F8VPZ5 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ercc6F8VPZ5 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ercc6F8VPZ5 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ercc6F8VPZ5 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ercc6F8VPZ5 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ercc6F8VPZ5 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ercc6F8VPZ5 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ercc6F8VPZ5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ercc6F8VPZ5 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ercc6F8VPZ5 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ercc6F8VPZ5 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Ercc6F8VPZ5 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ercc6F8VPZ5 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ercc6F8VPZ5 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ercc6F8VPZ5 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Ercc6F8VPZ5 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Ercc6F8VPZ5 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Ercc6F8VPZ5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Ercc6F8VPZ5 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ercc6F8VPZ5 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Ercc6F8VPZ5 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ercc6F8VPZ5 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Ercc6F8VPZ5 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ercc6F8VPZ5 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ercc6F8VPZ5 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ercc6F8VPZ5 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ercc6F8VPZ5 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ercc6F8VPZ5 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ercc6F8VPZ5 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ercc6F8VPZ5 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ercc6F8VPZ5 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ercc6F8VPZ5 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ercc6F8VPZ5 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ercc6F8VPZ5 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ercc6F8VPZ5 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Ercc6F8VPZ5 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ercc6F8VPZ5 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ercc6F8VPZ5 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ercc6F8VPZ5 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ercc6F8VPZ5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ercc6F8VPZ5 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ercc6F8VPZ5 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ercc6F8VPZ5 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ercc6F8VPZ5 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ercc6F8VPZ5 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ercc6F8VPZ5 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ercc6F8VPZ5 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ercc6F8VPZ5 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ercc6F8VPZ5 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms