Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-M1F7CXU4 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-M1F7CXU4 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-M1F7CXU4 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-M1F7CXU4 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-M1F7CXU4 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-M1F7CXU4 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-M1F7CXU4 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-M1F7CXU4 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-M1F7CXU4 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-M1F7CXU4 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-M1F7CXU4 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-M1F7CXU4 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-M1F7CXU4 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-M1F7CXU4 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-M1F7CXU4 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-M1F7CXU4 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-M1F7CXU4 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-M1F7CXU4 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-M1F7CXU4 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms