Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Crocc2F6XLV1 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Crocc2F6XLV1 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Crocc2F6XLV1 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Crocc2F6XLV1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Crocc2F6XLV1 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Crocc2F6XLV1 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Crocc2F6XLV1 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Crocc2F6XLV1 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Crocc2F6XLV1 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Crocc2F6XLV1 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Crocc2F6XLV1 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Crocc2F6XLV1 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Crocc2F6XLV1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Crocc2F6XLV1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Crocc2F6XLV1 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Crocc2F6XLV1 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Crocc2F6XLV1 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Crocc2F6XLV1 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Crocc2F6XLV1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Crocc2F6XLV1 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Crocc2F6XLV1 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Crocc2F6XLV1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Crocc2F6XLV1 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Crocc2F6XLV1 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Crocc2F6XLV1 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Crocc2F6XLV1 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Crocc2F6XLV1 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Crocc2F6XLV1 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Crocc2F6XLV1 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Crocc2F6XLV1 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Crocc2F6XLV1 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Crocc2F6XLV1 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Crocc2F6XLV1 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Crocc2F6XLV1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Crocc2F6XLV1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Crocc2F6XLV1 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Crocc2F6XLV1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Crocc2F6XLV1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Crocc2F6XLV1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Crocc2F6XLV1 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Crocc2F6XLV1 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Crocc2F6XLV1 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Crocc2F6XLV1 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Crocc2F6XLV1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Crocc2F6XLV1 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Crocc2F6XLV1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Crocc2F6XLV1 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Crocc2F6XLV1 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Crocc2F6XLV1 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Crocc2F6XLV1 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Crocc2F6XLV1 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Crocc2F6XLV1 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Crocc2F6XLV1 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Crocc2F6XLV1 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Crocc2F6XLV1 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Crocc2F6XLV1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Crocc2F6XLV1 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Crocc2F6XLV1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Crocc2F6XLV1 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Crocc2F6XLV1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Crocc2F6XLV1 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Crocc2F6XLV1 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Crocc2F6XLV1 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Crocc2F6XLV1 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Crocc2F6XLV1 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Crocc2F6XLV1 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Crocc2F6XLV1 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Crocc2F6XLV1 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Crocc2F6XLV1 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Crocc2F6XLV1 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Crocc2F6XLV1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Crocc2F6XLV1 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Crocc2F6XLV1 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Crocc2F6XLV1 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
Crocc2F6XLV1 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
Crocc2F6XLV1 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Crocc2F6XLV1 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Crocc2F6XLV1 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Crocc2F6XLV1 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Crocc2F6XLV1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Crocc2F6XLV1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Crocc2F6XLV1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Crocc2F6XLV1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Crocc2F6XLV1 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Crocc2F6XLV1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Crocc2F6XLV1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Crocc2F6XLV1 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Crocc2F6XLV1 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Crocc2F6XLV1 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Crocc2F6XLV1 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Crocc2F6XLV1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Crocc2F6XLV1 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Crocc2F6XLV1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Crocc2F6XLV1 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Crocc2F6XLV1 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Crocc2F6XLV1 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Crocc2F6XLV1 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Crocc2F6XLV1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Crocc2F6XLV1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms