Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms