Protein–RNA interactions for Protein: F2Z403

Defa27, Defensin, alpha, 27, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa27F2Z403 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa27F2Z403 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa27F2Z403 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa27F2Z403 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa27F2Z403 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa27F2Z403 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa27F2Z403 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa27F2Z403 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa27F2Z403 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa27F2Z403 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa27F2Z403 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa27F2Z403 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa27F2Z403 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa27F2Z403 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa27F2Z403 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa27F2Z403 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa27F2Z403 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa27F2Z403 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa27F2Z403 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa27F2Z403 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa27F2Z403 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa27F2Z403 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa27F2Z403 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa27F2Z403 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa27F2Z403 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa27F2Z403 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa27F2Z403 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa27F2Z403 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa27F2Z403 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa27F2Z403 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa27F2Z403 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa27F2Z403 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa27F2Z403 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa27F2Z403 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa27F2Z403 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa27F2Z403 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa27F2Z403 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa27F2Z403 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa27F2Z403 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa27F2Z403 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa27F2Z403 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa27F2Z403 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa27F2Z403 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa27F2Z403 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa27F2Z403 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa27F2Z403 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa27F2Z403 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa27F2Z403 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa27F2Z403 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa27F2Z403 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa27F2Z403 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa27F2Z403 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa27F2Z403 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa27F2Z403 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa27F2Z403 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa27F2Z403 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa27F2Z403 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa27F2Z403 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa27F2Z403 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa27F2Z403 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa27F2Z403 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa27F2Z403 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa27F2Z403 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa27F2Z403 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa27F2Z403 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa27F2Z403 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Defa27F2Z403 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Defa27F2Z403 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa27F2Z403 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa27F2Z403 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa27F2Z403 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa27F2Z403 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa27F2Z403 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa27F2Z403 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa27F2Z403 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa27F2Z403 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa27F2Z403 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa27F2Z403 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa27F2Z403 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa27F2Z403 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa27F2Z403 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa27F2Z403 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa27F2Z403 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa27F2Z403 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa27F2Z403 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa27F2Z403 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa27F2Z403 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa27F2Z403 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa27F2Z403 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa27F2Z403 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa27F2Z403 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa27F2Z403 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa27F2Z403 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa27F2Z403 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa27F2Z403 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa27F2Z403 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa27F2Z403 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa27F2Z403 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa27F2Z403 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa27F2Z403 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms