Protein–RNA interactions for Protein: E9QA15

Cald1, Caldesmon 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cald1E9QA15 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cald1E9QA15 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cald1E9QA15 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cald1E9QA15 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cald1E9QA15 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cald1E9QA15 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cald1E9QA15 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cald1E9QA15 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cald1E9QA15 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cald1E9QA15 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cald1E9QA15 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cald1E9QA15 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Cald1E9QA15 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Cald1E9QA15 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cald1E9QA15 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cald1E9QA15 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cald1E9QA15 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cald1E9QA15 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cald1E9QA15 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cald1E9QA15 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cald1E9QA15 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cald1E9QA15 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cald1E9QA15 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cald1E9QA15 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cald1E9QA15 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cald1E9QA15 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cald1E9QA15 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cald1E9QA15 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cald1E9QA15 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cald1E9QA15 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cald1E9QA15 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cald1E9QA15 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cald1E9QA15 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cald1E9QA15 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cald1E9QA15 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cald1E9QA15 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cald1E9QA15 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cald1E9QA15 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cald1E9QA15 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cald1E9QA15 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cald1E9QA15 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cald1E9QA15 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cald1E9QA15 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cald1E9QA15 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cald1E9QA15 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cald1E9QA15 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Cald1E9QA15 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cald1E9QA15 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cald1E9QA15 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cald1E9QA15 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cald1E9QA15 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cald1E9QA15 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cald1E9QA15 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cald1E9QA15 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cald1E9QA15 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cald1E9QA15 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cald1E9QA15 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cald1E9QA15 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cald1E9QA15 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cald1E9QA15 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cald1E9QA15 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cald1E9QA15 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Cald1E9QA15 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cald1E9QA15 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cald1E9QA15 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cald1E9QA15 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cald1E9QA15 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Cald1E9QA15 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cald1E9QA15 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cald1E9QA15 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cald1E9QA15 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cald1E9QA15 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cald1E9QA15 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Cald1E9QA15 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cald1E9QA15 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cald1E9QA15 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cald1E9QA15 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Cald1E9QA15 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cald1E9QA15 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cald1E9QA15 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cald1E9QA15 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cald1E9QA15 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cald1E9QA15 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cald1E9QA15 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cald1E9QA15 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cald1E9QA15 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cald1E9QA15 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cald1E9QA15 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cald1E9QA15 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cald1E9QA15 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cald1E9QA15 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cald1E9QA15 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cald1E9QA15 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cald1E9QA15 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cald1E9QA15 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cald1E9QA15 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cald1E9QA15 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cald1E9QA15 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cald1E9QA15 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cald1E9QA15 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms