Protein–RNA interactions for Protein: E9Q8N6

Aknad1, AKNA domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aknad1E9Q8N6 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Aknad1E9Q8N6 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Aknad1E9Q8N6 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Aknad1E9Q8N6 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Aknad1E9Q8N6 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Aknad1E9Q8N6 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Aknad1E9Q8N6 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Aknad1E9Q8N6 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Aknad1E9Q8N6 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Aknad1E9Q8N6 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Aknad1E9Q8N6 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Aknad1E9Q8N6 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Aknad1E9Q8N6 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Aknad1E9Q8N6 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Aknad1E9Q8N6 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Aknad1E9Q8N6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Aknad1E9Q8N6 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Aknad1E9Q8N6 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Aknad1E9Q8N6 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Aknad1E9Q8N6 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Aknad1E9Q8N6 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Aknad1E9Q8N6 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Aknad1E9Q8N6 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Aknad1E9Q8N6 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Aknad1E9Q8N6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Aknad1E9Q8N6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Aknad1E9Q8N6 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Aknad1E9Q8N6 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Aknad1E9Q8N6 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Aknad1E9Q8N6 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Aknad1E9Q8N6 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Aknad1E9Q8N6 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Aknad1E9Q8N6 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Aknad1E9Q8N6 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Aknad1E9Q8N6 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Aknad1E9Q8N6 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Aknad1E9Q8N6 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Aknad1E9Q8N6 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Aknad1E9Q8N6 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Aknad1E9Q8N6 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Aknad1E9Q8N6 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Aknad1E9Q8N6 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Aknad1E9Q8N6 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Aknad1E9Q8N6 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Aknad1E9Q8N6 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Aknad1E9Q8N6 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Aknad1E9Q8N6 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Aknad1E9Q8N6 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Aknad1E9Q8N6 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Aknad1E9Q8N6 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Aknad1E9Q8N6 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Aknad1E9Q8N6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Aknad1E9Q8N6 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Aknad1E9Q8N6 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Aknad1E9Q8N6 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Aknad1E9Q8N6 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Aknad1E9Q8N6 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Aknad1E9Q8N6 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Aknad1E9Q8N6 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Aknad1E9Q8N6 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Aknad1E9Q8N6 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Aknad1E9Q8N6 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Aknad1E9Q8N6 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Aknad1E9Q8N6 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Aknad1E9Q8N6 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Aknad1E9Q8N6 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Aknad1E9Q8N6 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Aknad1E9Q8N6 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Aknad1E9Q8N6 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Aknad1E9Q8N6 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Aknad1E9Q8N6 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Aknad1E9Q8N6 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Aknad1E9Q8N6 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Aknad1E9Q8N6 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Aknad1E9Q8N6 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Aknad1E9Q8N6 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Aknad1E9Q8N6 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Aknad1E9Q8N6 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Aknad1E9Q8N6 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Aknad1E9Q8N6 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Aknad1E9Q8N6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Aknad1E9Q8N6 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Aknad1E9Q8N6 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Aknad1E9Q8N6 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Aknad1E9Q8N6 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Aknad1E9Q8N6 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Aknad1E9Q8N6 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Aknad1E9Q8N6 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Aknad1E9Q8N6 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Aknad1E9Q8N6 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Aknad1E9Q8N6 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Aknad1E9Q8N6 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Aknad1E9Q8N6 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Aknad1E9Q8N6 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Aknad1E9Q8N6 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Aknad1E9Q8N6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Aknad1E9Q8N6 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Aknad1E9Q8N6 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Aknad1E9Q8N6 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Aknad1E9Q8N6 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms